V2.1:
- Corrección de errores
V2.0:
Encuentros salvajes:
- Se ha mejorado la presencia de Pokémon salvajes en toda la región. (Por ejemplo, en las Ruinas Alfa, donde además de Unown, también puedes capturar fósiles).
- Los Pokémon añadidos al juego son: Snorunt, Glalie, Froslass, Baltoy, Claydol, Croagunk, Toxicroak, Beldum, Metang y Metagross.
- Los pseudo legendarios como Tyranitar, Salamence y Garchomp tienen un 2% de probabilidad de aparecer en el Monte Plateado, la Ruta 28 y la Calle Victoria.
Combates contra jefes:
- ¡Azul ha aparecido en el juego justo antes de la Calle Victoria como nuevo jefe!
- El combate contra Koga en Ciudad Iris ahora es un combate doble.
- El equipo de algunos jefes ha sufrido ligeros cambios en su estrategia, Pokémon y movimientos.
- También se ha modificado ligeramente el límite de nivel.
- Las batallas contra jefes ahora tienen menos objetos curativos para que sean más justas; algunas batallas no tienen objetos curativos en absoluto.
Más amigable para Nuzlocke:
- Más MT y objetos raros dispersos por la región. Por ejemplo, MT Filo Roca, Demolición, Espacio Raro y MO05 Despejar en las Ruinas Alfa, Orbe Tóxico y Orbe Llama, Bola Luminosa, Lupa.
- Los Pokémon salvajes de Johto llevan un objeto equipado al 100% para obtener objetos raros más rápido en el juego.
Otros cambios:
- Algunos conjuntos de movimientos, niveles de evolución y estadísticas de Pokémon han cambiado. (Vulpix y Kofling tienen mayor ataque especial, (los fósiles obtienen Poder Antiguo antes)).
- Algunos Pokémon tienen una mejor tasa de crecimiento y captura.
- Más Pokémon de tipo Bicho, como Parasect y Ariados, pueden aprender Ida y Vuelta.
- Los Pokémon iniciales tienen una habilidad secundaria.
¿Qué no ha cambiado?
- La potencia base de los movimientos y los tipos de algunos Pokémon.
Nuevas MTs y ubicaciones:
- Route 31 MT Frustration
- Route 32 MT Flash
- Sprout Tower MT Hidden Power (reward Elder Li)
- Ruins of Alph MT Psych up
- Ruins of Alph MO Defog
- Slowpoke Well MT Rain Dance
- Slowpoke Well (Surf) MT Brick Break
- Ilex Forest Light Ball
- Ilex Forest Moon stone (reward Karen)
- Route 34 (Gate) MT Captivate
- Burned Tower MT Taunt
- Route 38 gate MT Will-O-Wisp
- Cianwood City MT Bulk Up
- MT Poison Jab
- Route 38 MT Silver Wind
- Route 42 MT Rock Polish
- Mt. Mortar (Waterfall) MT Aerial Ace
- Mt. Mortar (Waterfall) MT Flamethrower
- Route 43 MT Thunderwave
- Lake Of Rage MT Dream Eater
- Ice Path MT Rock Slide
- Route 45 MT ThunderBolt
- Route 46 MT Torment
- Whirl Islands MT Brine
- Bell Tower MT Flash Cannon
- Bell Tower MT Energy Ball
- Route 27 MT Dragon Claw
- Mt. Silver Ice Cave MT Ice Beam
- Mt. Silver MT Overheat
- Mt. Silver MT Earthquake
- Mt. Silver/ Route 28 MT Sword Dance
- Route 28 MT Psychic
- Victory Road Gate MT Trick Room (reward Blue)
- Victory Road MT Stone Edge